Фокс Макклауд повертається!
Генерал Пеппер захворів і просить, щоб його місце зайняв (тепер уже старий) Пеппі Гейр. Тим часом з'ясовується, що у Веномі є кислотні океани, в яких мешкають небезпечні англари. Тепер команда повинна знову врятувати систему Лайлат!
Одиночна гра
Режим одиночної гри розділений на тридцять бойових місій на карті та бойових місій у битвах. У режимі карти ви керуєте своїми Arwings за допомогою стилуса. Під час бою ви переміщуєте свій Arwing, проводячи стилусом вліво/вправо. Управління бомбами здійснюється за допомогою сенсорного екрана. Стріляти з гармат можна будь-якою кнопкою, крім Start/Select.
До 6 гравців
Режим Wi-Fi для шести гравців у Star Fox Command нагадує режим Shine Runner з Mario Kart DS і багатокористувацької гри Star Fox 64. Ви збиваєте своїх друзів заради зірок.
нові пілоти
У Star Fox Command є нові пілоти (Octoman - один з пілотів CPU) і кораблі, кілька кінцівок і новий генератор тарабарщини (створюйте свої власні звуки для пілотів). У грі також є підтримка нового пакета DS rumble pak.