У 2016 році відбувається немислиме: Атомна війна в Саудівській Аравії не тільки вбиває більше шести мільйонів чоловік, але і порушує потік нафти в інший світ. Як наслідок, через рік Америка і Європа будують глобальну мережу протиракетної оборони в космосі, а Росія стає найважливішим постачальником енергоносіїв і пізнає справжнє обіцянку економічного буму, знову перетворює її в супердержаву. Європа також об'єднується під прапором Європейської Федерації - але вже без Сполученого Королівства.
Зараз на дворі 2020 рік, і Сполучені Штати майже закінчили будівництво своєї "Зірки свободи" - орбітальної платформи важкої зброї, яка знову змінить баланс сил на планеті і значно посилить напругу між трьома наддержавами. Це лише питання часу, поки це напругу не виллється в останню війну, яку людство коли-небудь буде вести: Війну кінця світу.
Tom Clancy's EndWar - це стратегія в реальному часі без будівництва бази і управління одним юнітом. Замість цього гравець управляє загонами артилерійських кораблів, танків і т.п., маючи можливість замовити підкріплення після закінчення певного часу. Однак гравцеві слід піклуватися про свої загони, так як вони набираються досвіду в ході битви і просуваються на шість рангів після успішної битви, роблячи їх все більш і більш потужними. Можна навіть покращувати загони в чотирьох категоріях "Атака", "Захист", "Мобільність" і "Майстерність" за допомогою кредитів, зароблених в кінці кожної місії.
Що робить Tom Clancy's EndWar унікальною, так це спосіб управління. Замість використання курсора всі дії виконуються за допомогою голосових команд.
В одиночній кампанії гравцеві належить управляти всіма трьома арміями, борючись з усього світу проти невідомої терористичної угруповання. У грі також передбачені битви 1 на 1 і 2 на 2 з ботами, кооперативна кампанія і постійний онлайн-сценарій Третьої світової війни, в якому тисячі гравців борються за світове панування, приєднавшись до однієї з трьох фракцій і допомагаючи завойовувати і захищати точки на карті світу . До них відносяться бази ВПС, які дають доступ до повітряних ударів і додатковим піхотним підрозділам, а також столиці, які необхідно завоювати в три етапи. Раз в день виходить оновлення кампанії, яке оновлює карту, відображаючи територіальні зміни на основі боїв, проведених за останні 24 години.