Дія гри Tom Clancy's Ghost Recon 2 розгортається в недалекому майбутньому і ставить гравця на місце висококваліфікованого оперативника, який працює у складі сумнозвісного військового підрозділу американського спецназу, відомого тільки як "Примари".
Дія гри розгортається в Північній Кореї, де злісний генерал перенаправляє всю гуманітарну допомогу, щоб посилити свої війська та отримати більше політичної влади в процесі, і саме "Примарам" належить усунути цю загрозу.
В одиночній грі є режим кампанії, де гравець у складі загону "Примари" має битися зі злим генералом в 11 різних і досить тривалих місіях. Також є розраховані на багато користувачів режими як в режимі онлайн, так і офлайн. Основну кампанію можна пройти з другом або битися з іншими гравцями в декількох режимах гри, починаючи від простого deathmatch і закінчуючи командними режимами.
Новинкою цієї частини серії є можливість використовувати думку від третьої особи, але класичний вигляд "від очей" також доступний.