FIFA 16 - це третя гра для нового на той час покоління консолей у футбольній серії EA Sports FIFA з паритетом функцій для версії для ПК, як і рік тому. Найбільш типовим оновленням є актуалізований вміст для стадіонів, команд (як національних ліг, так і національних команд) та статистики гравців. Вперше в серії, жіночі команди входять до складу дванадцяти національних команд. Ці матчі можна проводити в різних ігрових режимах: офлайн та онлайн-ігри, а також турнірний режим, заснований на Чемпіонаті світу з футболу серед жінок. Змішані матчі неможливі.
Основний режим кар'єри оновлюється новим режимом навчання. Він використовується для розвитку гравців, і це робиться за допомогою "skill game", подібно до того, як це було представлено в 2014 році в FIFA World Cup Brazil. Це заохочується для підвищення трансферної вартості гравця. До нового сезону можна зіграти європейський турнір, щоб заробити додаткові стартові гроші. Також оновлюється звичний режим Ultimate Team, орієнтований на побудову команди за допомогою різних колод карт. Існують деякі зміни в інтерфейсі та системах фільтрації для трансферного ринку. Версії для різних платформ здебільшого однакові. Legends (легендарні гравці) ексклюзивні для версій Xbox, серед таких гравців, як Деко, Літманен та Гіггз. FUT Draft - це новий елемент цього режиму, як спрощена версія основного ігрового режиму, але заснована на підборі з п’яти гравців, і де важлива "командна хімія".