Medal of Honor: Rising Sun - это шутер от первого лица. В игре есть два многопользовательских режима: Deathmatch - свободный для всех матч, и Team Deathmatch, в котором игрок может выбирать команды. Онлайновый мультиплеер стал одним из наиболее успешных элементов игры, появившись в то время, когда онлайновые игры для PlayStation 2 не были широко доступны. Онлайновый режим привлек и сохранил верных игроков вплоть до его закрытия в январе 2007 года. В игре также есть кампания для двух игроков, которая следует тому же сюжету (за исключением саботажа суперкорабля) и позволяет одному из игроков возродиться, если другой остался жив. Однако в ней отсутствует многое из того, что есть в основной кампании, включая инструмент для рытья окопов, мачете и большинство ваших товарищей по отряду. Также доступен оффлайн мультиплеер, в котором до четырех человек могут играть друг против друга и, по желанию, против ботов ИИ.
7 декабря 1941 года капрал морской пехоты США Джозеф Д. "Джо" Гриффин просыпается на корабле USS California от известия о нападении на Перл-Харбор. Он пробирается наверх, туша пожары и помогая членам экипажа, и встречается с сержантом Джеком "Ганни" Лаутоном, своим командиром. Джо работает, сбивая самолеты и уничтожая торпеды. Его сдувает с корабля, но его спасает катер, в котором находятся Ганни, рядовой первого класса Фрэнк Спинелли и рядовой первого класса Сайлас Уитфилд. Джо садится в турель и сбивает самолеты, защищая линкор. Став свидетелями потопления корабля ВМС США "Аризона", они защищают корабль ВМС США "Невада", пытающийся покинуть гавань.