В игре Predator игроки управляют отрядом из 3 бойцов спецназа Ghost (из 8 возможных персонажей 5 различных классов, включая разведчика, стрелка поддержки, стрелка, дробовика и медика), охотясь на террористов в джунглях и на базах в Шри-Ланке. Геймплей и пользовательский интерфейс в значительной степени основаны на геймплее Xbox 360 версии Ghost Recon Advanced Warfighter и консольной версии Ghost Recon Advanced Warfighter 2. Это шутер от третьего лица, основанный на прикрытии, с упором на тактические приказы отряда. В отличие от Ghost Recon 2 или Ghost Recon: Advanced Warfighter, игрок может динамически переключаться между управлением всеми тремя своими товарищами по отряду Ghost, вместо того чтобы управлять только одним главным героем.
После того, как экипаж нескольких американских добывающих судов у берегов Шри-Ланки был убит неизвестными, команда солдат спецназа Ghost под командованием полковника Скотта Митчелла тайно отправляется в Шри-Ланку, чтобы разобраться в ситуации. На месте, в Шри-Ланке, "Призракам" помогают мистер Хисан и "Гвардия Мумпури" - неполитическая группа, созданная для защиты гражданского населения от различных вооруженных группировок, которые в настоящее время борются за контроль над страной.
Призраки получают разведданные от ЦРУ, согласно которым одна из вооруженных группировок, Народный фронт действий (также известный как Активисты), несет ответственность за расправу над экипажами американских кораблей. Призраки уничтожают несколько баз Активистов и в конце концов убивают их лидера, "Учителя". Однако, когда Учитель мертв, Призраки попадают в засаду, устроенную гораздо лучше оснащенной и более военизированной фракцией, известной как Лоялисты. После того как их спасает гвардия Мампури, Призраки начинают действовать против Лоялистов, в том числе спасают полковника Митчелла после того, как его вертолет был сбит ими.
В конце концов Призраки узнают, что информатор ЦРУ на Шри-Ланке Дилип Хан является членом Лоялистов и предоставил США ложную информацию, уличающую Учителя в нападениях на американские корабли. На самом деле эти нападения были проведены Лоялистами как операция под ложным флагом, чтобы обманом заставить США убить Учителя, чтобы фракция Активистов могла быть поглощена фракцией Лоялистов. Призраки захватывают Хана и заставляют его сделать признание, в результате чего Активисты и Лоялисты начинают войну друг с другом. Используя войну как прикрытие, Призраки проникают в штаб-квартиру лоялистов, чтобы спасти похищенного ими президента Шри-Ланки. Они также обнаруживают пропагандистскую передачу лоялистов, из которой становится известно, что лидером лоялистов является Сунил Ранга, министр энергетики.
Призраки проникают в поместье Ранги, где Ранга либо убит, либо захвачен, что положило конец военным действиям. Мистер Хисан благодарит их за их действия и сообщает, что "их здесь никогда не было".