Lego DC Super Villains — это первая видеоигра LEGO, которая полностью сосредоточится на злодеях Вселенной DC. Также, в отличие от предыдущих игр, игроки могут создать персонажа, который будет интегрирован в историю сюжета. По мере продвижения игроков в игре, новые возможности и настройки будут разблокированы для использования игроками. В игре также есть многопользовательский режим с двумя игроками.
Лига Справедливости исчезла, оставив защиту Земли своим коллегам из параллельной вселенной — «Преступному Синдикату», новой странной группы супер-героев-подражателей с неясными намерениями. Будь то граффити, распыляющие стены в Метрополисе или использование Токсина Страха, чтобы напугать персонажей в Готэме, у супер-злодеев есть полное правление, чтобы использовать любой трюк в своем арсенале, чтобы остановить злую схему Преступного Синдиката.