FIFA 16 - это третья игра для нового в то время поколения консолей в футбольной серии EA Sports FIFA с паритетом функций для версии для ПК, как и год назад. Наиболее типичным обновлением является актуализированное содержание для стадионов, команд (как национальных лиг, так и национальных команд) и статистики игроков. Впервые в серии, женские команды входят в состав двенадцати национальных команд. Эти матчи можно проводить в различных игровых режимах: офлайн и онлайн-игры, а также турнирный режим, основанный на Чемпионате мира по футболу среди женщин. Смешанные матче невозможны.
Основной режим карьеры обновляется новым режимом обучения. Он используется для развития игроков, и это делается с помощью "skill game", подобно тому, как это было представлено в 2014 году в FIFA World Cup Brazil. Это поощряется для повышения трансферной стоимости игрока. Перед новым сезоном можно сыграть европейский турнир, чтобы заработать дополнительные стартовые деньги. Также обновляется привычный режим Ultimate Team, ориентированный на построение команды с помощью различных колод карт. Существуют некоторые изменения в интерфейсе и системах фильтрации для трансферного рынка. Версии для разных платформ в основном одинаковы. Legends (легендарные игроки) эксклюзивные для версий Xbox, среди таких игроков, как Деко, Литманен и Гиггз. FUT Draft - это новый элемент этого режима, как упрощенная версия основного игрового режима, но основана на подборе из пяти игроков, и где важна "командная химия".