Bionicle Heroes - это игра от третьего лица, в которой игрок берет на себя роль различных Тоа Иники из Lego Bionicle - Джаллера, Маторо, Хахли, Конгу, Хевкии и Нупару. Эти герои носят маски силы Тоа - бонусы, которые можно найти на всех уровнях, чтобы получить различные способности, основанные на элементах. В игре также есть канистры Bionicle, которые помогают главным героям победить Везона - 7-го Пираку, укравшего Маску Жизни.
Игровой процесс сосредоточен на перестрелках с инопланетными "роботами" Вахки, Висораком и Бохроком. Игроки будут собирать детали Lego за каждого побежденного врага, и в конце концов откроют неуязвимый режим героя, чтобы помочь победить врагов Тоа.
Игра разделена на шесть различных тематических миров, а также центральный мир, где игрок может приобрести улучшения и бонусный контент. После победы над Пиракой в конце мира игрок попадает на площадку Пираки в центральном мире. Игрок может использовать собранные им детали Lego для покупки комичных сцен, в которых злодеи занимаются "дурачеством". Кроме того, можно разблокировать три бонусных уровня, которые представляют собой соревнование на количество очков, цель которого - победить как можно больше врагов. В игре есть 100 коллекционных предметов, которые можно собрать, а на каждом уровне также есть серебряные и золотые канистры, которые открывают новые предметы в пещере трофеев центрального мира. Пройденные уровни можно пересматривать в режиме свободной игры, где игрок может найти дополнительные предметы и коллекционные предметы.