У 2401 році морський піхотинець сержант Кортес залишає космічну станцію, яку він відвідав наприкінці своєї попередньої подорожі. Незабаром він виявляє, що знайдені ним кристали можуть привести в дію машину часу. Виявивши сліди діяльності Розщеплювачів часу в різних часових періодах на Землі, Кортес сідає в машину часу і подорожує в ці періоди, сподіваючись допомогти різним персонажам в їх битвах зі злом.
TimeSplitters: Future Perfect - це шутер від першої особи, в якому гравці проходять тринадцять сюжетних місій, що охоплюють шість часових періодів, як поодинці, так і в кооперативі. Арсенал головного героя змінюється в залежності від часового періоду, в який він потрапляє: наприклад, подорож у 1924 рік дозволить Кортесу володіти зброєю часів Першої світової війни; радянський сеттінг 1960-х років містить різноманітну місцеву вогнепальну зброю того періоду; етапи, що відбуваються в майбутньому, мають відповідну футуристичну зброю тощо. На додаток до динамічного стрілецького геймплею, в грі також присутні деякі стелс-сегменти та сегменти керування автомобілем.
Як і в попередніх частинах серії, передбачені різноманітні багатокористувацькі режими. Гравці можуть битися з комп'ютерними супротивниками на будь-якій з п'ятнадцяти аркадних карт або створювати свої власні. Гравці також можуть боротися за нагороди в десятках матчів аркадних ліг і випробувань. Можна вибрати одного з 150 персонажів і кинути виклик іншим гравцям в очному бою, або за допомогою розділеного екрану до чотирьох гравців, або в режимі онлайн і локальної мережі.