В 2401 году морской пехотинец сержант Кортез покидает космическую станцию, которую он посетил в конце своего предыдущего путешествия. Вскоре он обнаруживает, что найденные им кристаллы могут питать машину времени. Обнаружив следы деятельности TimeSplitter в различных временных периодах на Земле, Кортез садится на машину времени и отправляется в эти периоды, надеясь помочь различным героям в их борьбе со злом.
TimeSplitters: Future Perfect - это шутер от первого лица, в котором игрокам предстоит пройти тринадцать сюжетных миссий, охватывающих шесть временных периодов, в одиночку или в кооперативе. Арсенал главного героя меняется в зависимости от того, в какой временной период он попадает: например, путешествие в 1924 год позволит Кортезу использовать оружие времен Первой мировой войны; советская локация 1960-х годов содержит различное местное огнестрельное оружие того периода; этапы, происходящие в будущем, включают соответствующее футуристическое оружие и т. д. В дополнение к стремительной стрельбе в игре есть также некоторые сегменты стелса и вождения транспортных средств.
Как и в предыдущих частях серии, в игре присутствуют различные многопользовательские режимы. Игроки могут сражаться с управляемыми компьютером противниками на любой из пятнадцати аркадных карт или создавать свои собственные. Игроки также могут побороться за награды в десятках матчей аркадной лиги и испытаний. Можно выбрать одного из 150 персонажей и сразиться с другими игроками лоб в лоб, как в режиме разделенного экрана на четырех игроков, так и в сетевой и LAN-игре.