Hot Pixel - це казуальна гра, події якої відбуваються у пікселізованому всесвіті, змішаному з вуличної культури, цифрового способу життя та олдскульних відеоігор. Вона складається з 200 мікро-ігор, випадково вибраних з пулу в одному режимі, або згрупованих у 10 епізодів у другому режимі, пов'язаних між собою кат-сценами за участю підлітка DJON.
Кожна мікрогра триває лише кілька секунд, подібно до ігор WarioWare. За цей короткий проміжок часу гравець має з'ясувати, що він повинен зробити, за допомогою короткого речення, яке з'являється на початку гри. Існує також низка навчальних і тренувальних режимів. Після проходження певної кількості мікроігор гравцеві пропонується довша мікрогра з "босом", яка, як правило, є більш складною для проходження рівня. Деякі з ігор мають сугестивну тематику або грубий зміст.
Проходячи ігри, відкриваються нові або з різними режимами, наприклад, зі зняттям часового ліміту. Інші функції включають режим оцінювання різних персонажів, музичний автомат, список розблокованих відеофрагментів та плейлисти для створення списку улюблених ігор або обміну ними через Інтернет чи флеш-карти пам'яті. Плейлисти мають 3 режими: "Виклик" (гра на вибір), "Виживання" (спроба продовжити гру протягом певного часу) та "Вільна гра". Існує спеціальний багатокористувацький режим Ad Hoc, щоб змагатися з другом за кращий результат. Граючи добре, заповнюється датчик. При максимальному заповненні його можна використовувати для відправки "порушника спокою", який змінює відображення екрану супротивника.