Frogger: Helmet Chaos - платформер с видом сверху, главным героем которого является аркадная лягушка из восьмидесятых, но теперь уже в 3D. Основным игровым процессом по-прежнему является игра, поскольку лягушка перемещает один (невидимый) квадрат за нажатие клавиши, что сохраняет ощущение оригинальной аркадной игры вместо современной, более плавной механики движения.
Когда Фроггер залезает на дерево за лунным плодом для Тоуди, его друг уходит, когда он возвращается. Он следует по своим следам и обнаруживает, что Тоуди находится под контролем доктора Вани, который приказал своим мини-крокодилам надеть шлемы для контроля разума на всех жителей земли. Отменить это дело Фроггера.
Игра состоит из разных небольших уровней с элементами головоломки. Frogger можно перемещать на один квадрат за движение или на два при обычном прыжке. Эта механика чаще всего используется для навигации по платформам, похожим на лабиринты с водой. По иронии судьбы, Frogger тонет при прикосновении к жидкости. Во время передвижения он может собирать монеты, и есть контрольные точки для сохранения прогресса. Он может использовать свой язык, чтобы толкать или тянуть предметы, или раскачиваться на ветках. Также есть вертикальный прыжок, чтобы достичь объектов в воздухе, и он может повернуться на 90 градусов, чтобы смотреть в другом направлении. У лягушки ограниченное количество жизней, но их можно восстановить, взяв яблоко.
История продолжается через прорисованные последовательности кат-сцен со статическими изображениями и закадровым голосом (на PSP есть только письменный текст для версии DS). Версия для PSP поддерживает совместное использование игр, а на верхнем экране DS отображается игровая статистика в режиме истории. Также есть семь мини-игр, в том числе оригинальная аркада Frogger, но с отточенной графикой, а также шляпы и костюмы, которые можно разблокировать за собранные монеты.