Spider-Man: Web of Shadows - Amazing Allies Edition - это двухмерный сайд-скроллер с трехмерной графикой. Сюжет похож на версии для консолей седьмого поколения. Отколовшийся кусок симбионта Венома начинает заражать жителей Нью-Йорка, и спасти город должен сам Человек-паук. Он может в любой момент переключаться между задним и красным костюмами, у каждого из которых свой набор движений и способностей.
Когда Человек-паук побеждает врагов, он получает очки умений, которые можно использовать для приобретения усиленных характеристик и новых приемов. Для каждого костюма они свои. В общем, красный делает упор на ловкость, а черный - на жестокость. Чтобы приобрести новые приемы, нужно иметь не только необходимые очки, но и достаточную репутацию. На протяжении всей игры вы ведете беседы с другими персонажами, в которых вам предлагается выбрать красный, черный или нейтральный вариант. Ответ "красный" или "черный" повышает репутацию костюма, как и другие действия в игре.
На каждом уровне вы можете взять пять бонусов. Это могут быть специальные способности, например, временная неуязвимость, или одноименные союзники. При вызове они появляются на экране и наносят определенный тип урона, а затем исчезают. Союзники открываются после победы над боссами. Красный костюм открывает союзников героев, таких как Люк Кейдж и Шторм, а черный костюм открывает союзников злодеев, таких как Галактус и Хобгоблин.