Spider-Man: Web of Shadows - Amazing Allies Edition - це 2D сайдскроллер з 3D графікою. Історія схожа з консольними версіями сьомого покоління. Відкололася частина симбіонта Венома починає заражати жителів Нью-Йорка і саме Людині-павуку належить врятувати місто. Він може в будь-який момент перемикатися між чорним і червоним костюмами, кожен з яких має свій власний набір рухів і здібностей.
Коли Людина-павук перемагає ворогів, він отримує очки навичок, які можуть бути використані для придбання підвищеної статистики та нових рухів. Вони є окремими для кожного костюма. Загалом, червоний колір робить акцент на спритності, а чорний - на брутальності. Для того, щоб придбати прийоми, потрібно мати не тільки необхідні очки, але і достатню репутацію. Протягом гри ви ведете бесіди з іншими персонажами, де вам надається червоний, чорний або нейтральний вибір. Відповідь червоного або чорного кольору буде будувати репутацію цієї масті, так само як і різні інші дії протягом гри.
Ви можете взяти п'ять бонусів на кожен рівень. Це можуть бути особливі здібності, такі як тимчасова непереможність, або однойменні союзники. При виклику вони з'являються на екрані і наносять свій певний тип шкоди, після чого зникають. Союзники розблоковуються шляхом перемоги над босами. Червоний костюм відкриває союзників-героїв, таких як Люк Кейдж і Шторм, а чорний костюм відкриває союзників-лиходіїв, таких як Галактус і Хобгоблін.